La Maison des Sciences de l'Homme d'Aquitaine organise des colloques, journées d'études et séminaires nationaux et internationaux en sciences humaines et sociales. Ces rencontres sont principalement le résultat des travaux de recherches menés dans le cadre des axes de recherches définis par la Maison et soutenus par le Ministère de la Recherche et le Conseil Régional d'Aquitaine. Les centres de recherche des Universités d'Aquitaine et du CNRS, associés à la Maison des Sciences de l'Homme d'Aquitaine, la sollicitent pour certaines de leurs activités scientifiques.